Produk
Penemuan Peptida
Analisis NMR

                                                           

 

Ini adalah mesin yang digunakan untuk melakukan spektroskopi NMR. Sebagian besar mesin ini menggunakan magnet yang 500 megahertz sampai 900 megahertz.

 

 

NMR memungkinkan informasi struktural dan dinamis tiga dimensi untuk diperoleh dalam kondisi yang sedekat mungkin dengan kondisi fisiologis.dan interaksi protein-protein sementara dapat diselidiki..

 

Apa itu spektroskopi NMR, dan bagaimana cara kerjanya?

 

Spektroskopi NMR bekerja dengan menggunakan magnet alami - inti atom tertentu - di dalam protein. Magnet seluler alami tersebut berinteraksi dengan magnet besar di dalam mesin NMR.Magnet besar memaksa magnet protein untuk berbarisPeneliti kemudian meledakkan sampel dengan serangkaian pulsa gelombang radio pecahan detik dan mengamati bagaimana magnet protein merespons.Para ilmuwan menggunakan beberapa set ledakan NMR ini dan menggabungkan data untuk mendapatkan gambaran yang lebih lengkap tentang proteinMeskipun kristalografi sinar-X dapat memeriksa protein yang lebih besar daripada yang dapat dilakukan oleh NMR, teknologi NMR dapat mempelajari protein yang terendam dalam larutan cair.Kristallografi sinar-X membutuhkan protein disusun menjadi kristal.

 

Pengantar:

 

Resonansi Magnetik Nuklir (NMR) telah berkembang sebagai teknik utama untuk memperoleh informasi struktural pada resolusi atom dalam larutan pada makrobiomolekul seperti protein dan asam nukleat.solusi NMR adalah teknologi yang sangat diperlukan untuk menentukan tidak hanya struktur molekul tersebut tetapi juga interaksi mereka, bahkan lemah dan sementara, serta untuk mencirikan proses fungsional dalam larutan dan juga langsung dalam sel hidup.informasi kinetik dan termodinamika sehingga menjadikannya teknik pilihan dalam penelitian mutakhir di bidang kedokteran dan biologi.

 

Solusi NMR:

 

Solusi NMR dalam Instruct memberikan pendekatan utama untuk memperoleh informasi tingkat molekuler yang dibutuhkan untuk membangun jaringan interaksi yang bertanggung jawab atas proses sel vital,dan untuk menggambarkan mereka pada tingkat molekulerBerkat perkembangan perangkat keras dan perangkat lunak baru-baru ini, penerapannya berkisar dari struktur supramolekul hingga protein yang terkelompokan secara intrinsik pada konsentrasi hampir fisiologis.Solusi NMR menawarkan kemungkinan unik untuk mempelajari proses dinamis pada resolusi atom dan dalam rentang waktu yang sangat luas, dari pikosekund hingga jam, termasuk mekanisme lipatan dan pembentukan kompleks sementara.

 

NMR keadaan padat:

 

Sementara larutan NMR sudah menjadi teknik yang mapan untuk penentuan struktur biomolekul dalam larutan,solid state (SS) NMR telah mengalami kemajuan metodologis dan teknis yang luar biasa selama dekade terakhir, dan mencapai status teknik yang kuat untuk penyelidikan mekanis dan struktural dari padatan biologis.SS NMR secara intrinsik bebas dari keterbatasan yang dikenakan pada NMR keadaan cair oleh ukuran sistem yang sedang diselidiki, dan dapat menangani sistem molekuler yang tidak dapat ditangani oleh studi sinar-X seperti agregat dan fibril yang tidak larut.Kemungkinan baru yang menarik ditemukan hampir setiap hari dan SS NMR oleh karena itu diharapkan untuk membuka jalan baru untuk biologi modern dalam waktu dekat.

 

SS NMR dalam Instruct menyediakan alat yang sangat berharga untuk menentukan struktur dan dinamika sistem yang berada di luar jangkauan metode struktural lainnya.mulai dari protein membran hingga bahan nano-kristalin hingga agregat dan fibril yang tidak larutInstrumen dan protokol eksperimen mutakhir memungkinkan penentuan sejumlah parameter biofisika yang memungkinkan, bersama dengan penentuan struktural,Karakterisasi dinamika internal dan global dari sistem pada detail atomFitur-fitur ini membuat SS NMR merupakan teknik penting dalam biologi struktural.

 

Relaksometri bersepeda cepat:

 

Fast field cycling relaxometry adalah alat untuk mengukur tingkat relaksasi nuklir dari medan magnet yang sangat rendah (0,01 MHz frekuensi proton Larmor) hingga 1 T (sekitar 45 MHz frekuensi proton Larmor).Ketergantungan medan tingkat relaksasi memberikan informasi tentang karakteristik struktural dan dinamis molekul dan, dalam kasus sistem paramagnetik, pada relaksasi elektron.

 

Pengukuran relaksometri biasanya dilakukan dalam larutan air. Mereka memberikan informasi tentang waktu korelasi yang memodulasi interaksi dipolar antara proton,dan dengan demikian pada waktu reorientasi dan agregasi negara sistemPengukuran relaksometri dapat berguna untuk menentukan keberadaan ikatan antara makromolekul atau antara kompleks paramagnetik kecil dan makromolekul,serta untuk mempelajari mekanisme yang bertanggung jawab atas relaksasi elektronHal ini sebagian besar digunakan untuk karakterisasi agen kontras untuk pencitraan resonansi magnetik (MRI) dan untuk optimalisasi mereka.Teknik ini juga berhasil diterapkan untuk karakterisasi radikal untuk aplikasi untuk polarisasi nuklir dinamis (DNP).

 

Resonansi Paramagnetik Elektron (EPR):

 

Electron Paramagnetic Resonance (EPR) mengukur penyerapan radiasi elektromagnetik oleh sistem paramagnetik yang ditempatkan di medan magnet statis.Aplikasi standar dari EPR termasuk karakterisasi radikal bebas, studi reaksi yang melibatkan radikal/logam paramagnetik, dan penyelidikan sifat elektronik dan struktural pusat paramagnetik.Dalam sistem biologis yang kompleks dengan pusat paramagnetik yang stabil atau transien (yang bisa berupa ion logam atau kelompok, label spin, radikal asam amino, atau radikal kofaktor organik) EPR digunakan untuk mempelajari susunan kofaktor dan subunit, pembentukan elemen struktur sekunder,atau interaksi antara biomolekul.

 

Informasi yang diperoleh digunakan dalam penentuan struktur molekul. Keakuratan informasi struktural ini sering melebihi metode lain.Data spektroskopis EPR memberikan satu-satunya informasi struktural, terutama ketika kristal resolusi tinggi tidak tersedia dan sistem terlalu besar untuk spektroskopi NMR resolusi tinggi.Data EPR dapat melengkapi informasi yang diperoleh oleh metodologi struktural lainnya, dan telah terbukti sebagai teknik penting untuk penyelidikan interdisipliner sistem biologis.

 

Apa yang bisa kita lakukan dengan MRI:

 

  • Peptides are a growing class of therapeutics and defined by the US Food and Drug Administration (FDA) as a polymer composed of 40 or fewer amino acid residues regardless of source or origin of the drug.
  • Peptida dapat mengadopsi struktur orde lebih tinggi (HOS) yang mencakup bentuk struktural sekunder, tersier, dan kuarter (yaitu, oligomer dalam larutan).HOS adalah atribut kualitas fisik dari peptida formulasiSebuah keseimbangan dapat ada antara bentuk HOS yang berbeda termasuk pertukaran konformasional antara keadaan lipat dan tidak lipat dan antara keadaan monomer dan oligomer.
  • Produk obat berbasis protein merupakan tantangan untuk pemeriksaan kualitas karena formulasi yang kompleks dan heterogenitas yang melekat dalam struktur protein.Metode analisis resolusi yang lebih tinggi diperlukan untuk memastikan kesamaan struktural dan komposisi antara terapi protein yang mengandung zat obat yang samaSelain struktur protein orde tinggi yang dieksplorasi dengan NMR, dikroisme sirkular (CD) atau pendekatan lainnya, agregasi protein yang tidak terlihat menimbulkan risiko imunogenitas terhadap keamanan obat.
  • Karena nuclear magnetic resonance (NMR) telah menjadi satu-satunya metode spektroskopis resolusi atom untuk memperoleh struktur tiga dimensi dari peptida dalam larutan,ini berfungsi sebagai pendekatan canggih untuk pengukuran kesamaan HOS.

 

Analisis NMR Peptida KS-VPlatform Layanan:

 

  • Evaluasi konsistensi struktural lanjutan dari obat peptide generik atau analog biologis: termasuk perbandingan kualitatif spektrum dan berbagai model perbandingan kuantitatif seperti CCSD,analisis kemometrik (PCA dan perhitungan jarak), regresi linier, metode kontur puncak korelasi 2D, digunakan untuk aplikasi FDA.
  • Penentuan pergeseran kimia dari peptida
  • Analisis lokalisasi ikatan disulfida dalam obat peptida
  • Analisis struktur larutan dan perhitungan peptida
  • Identifikasi struktur kotoran dalam obat peptida sintetis
  • Interaksi ligand protein, seperti titrasi magnetik nuklir, STD, WaterLOGSY

 

             

Produk
Penemuan Peptida
Rumah >

Penemuan Peptida >

NMR Analysis

Analisis NMR

                                                           

 

Ini adalah mesin yang digunakan untuk melakukan spektroskopi NMR. Sebagian besar mesin ini menggunakan magnet yang 500 megahertz sampai 900 megahertz.

 

 

NMR memungkinkan informasi struktural dan dinamis tiga dimensi untuk diperoleh dalam kondisi yang sedekat mungkin dengan kondisi fisiologis.dan interaksi protein-protein sementara dapat diselidiki..

 

Apa itu spektroskopi NMR, dan bagaimana cara kerjanya?

 

Spektroskopi NMR bekerja dengan menggunakan magnet alami - inti atom tertentu - di dalam protein. Magnet seluler alami tersebut berinteraksi dengan magnet besar di dalam mesin NMR.Magnet besar memaksa magnet protein untuk berbarisPeneliti kemudian meledakkan sampel dengan serangkaian pulsa gelombang radio pecahan detik dan mengamati bagaimana magnet protein merespons.Para ilmuwan menggunakan beberapa set ledakan NMR ini dan menggabungkan data untuk mendapatkan gambaran yang lebih lengkap tentang proteinMeskipun kristalografi sinar-X dapat memeriksa protein yang lebih besar daripada yang dapat dilakukan oleh NMR, teknologi NMR dapat mempelajari protein yang terendam dalam larutan cair.Kristallografi sinar-X membutuhkan protein disusun menjadi kristal.

 

Pengantar:

 

Resonansi Magnetik Nuklir (NMR) telah berkembang sebagai teknik utama untuk memperoleh informasi struktural pada resolusi atom dalam larutan pada makrobiomolekul seperti protein dan asam nukleat.solusi NMR adalah teknologi yang sangat diperlukan untuk menentukan tidak hanya struktur molekul tersebut tetapi juga interaksi mereka, bahkan lemah dan sementara, serta untuk mencirikan proses fungsional dalam larutan dan juga langsung dalam sel hidup.informasi kinetik dan termodinamika sehingga menjadikannya teknik pilihan dalam penelitian mutakhir di bidang kedokteran dan biologi.

 

Solusi NMR:

 

Solusi NMR dalam Instruct memberikan pendekatan utama untuk memperoleh informasi tingkat molekuler yang dibutuhkan untuk membangun jaringan interaksi yang bertanggung jawab atas proses sel vital,dan untuk menggambarkan mereka pada tingkat molekulerBerkat perkembangan perangkat keras dan perangkat lunak baru-baru ini, penerapannya berkisar dari struktur supramolekul hingga protein yang terkelompokan secara intrinsik pada konsentrasi hampir fisiologis.Solusi NMR menawarkan kemungkinan unik untuk mempelajari proses dinamis pada resolusi atom dan dalam rentang waktu yang sangat luas, dari pikosekund hingga jam, termasuk mekanisme lipatan dan pembentukan kompleks sementara.

 

NMR keadaan padat:

 

Sementara larutan NMR sudah menjadi teknik yang mapan untuk penentuan struktur biomolekul dalam larutan,solid state (SS) NMR telah mengalami kemajuan metodologis dan teknis yang luar biasa selama dekade terakhir, dan mencapai status teknik yang kuat untuk penyelidikan mekanis dan struktural dari padatan biologis.SS NMR secara intrinsik bebas dari keterbatasan yang dikenakan pada NMR keadaan cair oleh ukuran sistem yang sedang diselidiki, dan dapat menangani sistem molekuler yang tidak dapat ditangani oleh studi sinar-X seperti agregat dan fibril yang tidak larut.Kemungkinan baru yang menarik ditemukan hampir setiap hari dan SS NMR oleh karena itu diharapkan untuk membuka jalan baru untuk biologi modern dalam waktu dekat.

 

SS NMR dalam Instruct menyediakan alat yang sangat berharga untuk menentukan struktur dan dinamika sistem yang berada di luar jangkauan metode struktural lainnya.mulai dari protein membran hingga bahan nano-kristalin hingga agregat dan fibril yang tidak larutInstrumen dan protokol eksperimen mutakhir memungkinkan penentuan sejumlah parameter biofisika yang memungkinkan, bersama dengan penentuan struktural,Karakterisasi dinamika internal dan global dari sistem pada detail atomFitur-fitur ini membuat SS NMR merupakan teknik penting dalam biologi struktural.

 

Relaksometri bersepeda cepat:

 

Fast field cycling relaxometry adalah alat untuk mengukur tingkat relaksasi nuklir dari medan magnet yang sangat rendah (0,01 MHz frekuensi proton Larmor) hingga 1 T (sekitar 45 MHz frekuensi proton Larmor).Ketergantungan medan tingkat relaksasi memberikan informasi tentang karakteristik struktural dan dinamis molekul dan, dalam kasus sistem paramagnetik, pada relaksasi elektron.

 

Pengukuran relaksometri biasanya dilakukan dalam larutan air. Mereka memberikan informasi tentang waktu korelasi yang memodulasi interaksi dipolar antara proton,dan dengan demikian pada waktu reorientasi dan agregasi negara sistemPengukuran relaksometri dapat berguna untuk menentukan keberadaan ikatan antara makromolekul atau antara kompleks paramagnetik kecil dan makromolekul,serta untuk mempelajari mekanisme yang bertanggung jawab atas relaksasi elektronHal ini sebagian besar digunakan untuk karakterisasi agen kontras untuk pencitraan resonansi magnetik (MRI) dan untuk optimalisasi mereka.Teknik ini juga berhasil diterapkan untuk karakterisasi radikal untuk aplikasi untuk polarisasi nuklir dinamis (DNP).

 

Resonansi Paramagnetik Elektron (EPR):

 

Electron Paramagnetic Resonance (EPR) mengukur penyerapan radiasi elektromagnetik oleh sistem paramagnetik yang ditempatkan di medan magnet statis.Aplikasi standar dari EPR termasuk karakterisasi radikal bebas, studi reaksi yang melibatkan radikal/logam paramagnetik, dan penyelidikan sifat elektronik dan struktural pusat paramagnetik.Dalam sistem biologis yang kompleks dengan pusat paramagnetik yang stabil atau transien (yang bisa berupa ion logam atau kelompok, label spin, radikal asam amino, atau radikal kofaktor organik) EPR digunakan untuk mempelajari susunan kofaktor dan subunit, pembentukan elemen struktur sekunder,atau interaksi antara biomolekul.

 

Informasi yang diperoleh digunakan dalam penentuan struktur molekul. Keakuratan informasi struktural ini sering melebihi metode lain.Data spektroskopis EPR memberikan satu-satunya informasi struktural, terutama ketika kristal resolusi tinggi tidak tersedia dan sistem terlalu besar untuk spektroskopi NMR resolusi tinggi.Data EPR dapat melengkapi informasi yang diperoleh oleh metodologi struktural lainnya, dan telah terbukti sebagai teknik penting untuk penyelidikan interdisipliner sistem biologis.

 

Apa yang bisa kita lakukan dengan MRI:

 

  • Peptides are a growing class of therapeutics and defined by the US Food and Drug Administration (FDA) as a polymer composed of 40 or fewer amino acid residues regardless of source or origin of the drug.
  • Peptida dapat mengadopsi struktur orde lebih tinggi (HOS) yang mencakup bentuk struktural sekunder, tersier, dan kuarter (yaitu, oligomer dalam larutan).HOS adalah atribut kualitas fisik dari peptida formulasiSebuah keseimbangan dapat ada antara bentuk HOS yang berbeda termasuk pertukaran konformasional antara keadaan lipat dan tidak lipat dan antara keadaan monomer dan oligomer.
  • Produk obat berbasis protein merupakan tantangan untuk pemeriksaan kualitas karena formulasi yang kompleks dan heterogenitas yang melekat dalam struktur protein.Metode analisis resolusi yang lebih tinggi diperlukan untuk memastikan kesamaan struktural dan komposisi antara terapi protein yang mengandung zat obat yang samaSelain struktur protein orde tinggi yang dieksplorasi dengan NMR, dikroisme sirkular (CD) atau pendekatan lainnya, agregasi protein yang tidak terlihat menimbulkan risiko imunogenitas terhadap keamanan obat.
  • Karena nuclear magnetic resonance (NMR) telah menjadi satu-satunya metode spektroskopis resolusi atom untuk memperoleh struktur tiga dimensi dari peptida dalam larutan,ini berfungsi sebagai pendekatan canggih untuk pengukuran kesamaan HOS.

 

Analisis NMR Peptida KS-VPlatform Layanan:

 

  • Evaluasi konsistensi struktural lanjutan dari obat peptide generik atau analog biologis: termasuk perbandingan kualitatif spektrum dan berbagai model perbandingan kuantitatif seperti CCSD,analisis kemometrik (PCA dan perhitungan jarak), regresi linier, metode kontur puncak korelasi 2D, digunakan untuk aplikasi FDA.
  • Penentuan pergeseran kimia dari peptida
  • Analisis lokalisasi ikatan disulfida dalam obat peptida
  • Analisis struktur larutan dan perhitungan peptida
  • Identifikasi struktur kotoran dalam obat peptida sintetis
  • Interaksi ligand protein, seperti titrasi magnetik nuklir, STD, WaterLOGSY